A Szent Pál Akadémiát (korábbi nevén: Közép-kelet-európai Bibliaiskola és Lelkészképző Intézetet) a Hit Gyülekezete alapította 1990-ben. Az intézményt a felsőoktatásról szóló 2005. évi CXXXIX. törvény a Magyar Köztársaság államilag elismert felsőoktatási intézményei között sorolja fel. Az oktatás az 1990/91-es tanévben kezdődött teológiai szakon nappali és levelező tagozaton. A teológusi végzettséget adó oklevelet az először végző nappali tagozatos évfolyam 1994. nyarán vehette át. 2007. szeptemberétől az Akadémián teológia egységes, osztatlan mesterképzés indult, mely nappali és levelező tagozaton egyaránt öt éves. A mesterképzés minden tanévben egy újabb első évfolyammal bővül, vagyis felmenő rendszerben épül fel.